Војнотехничким споразумом формирана је и Заједничка комисија за његову примену, састављена од комисије КФОР-а и комисије коју чине представници Војске и МУП-а Србије. Комисија за примену Војнотехничког споразума је стручни орган Генералштаба ВојскеСрбије, који непосредно комуницира са КФОР-ом од јуна 1999. године.

Од уласка наше војске у КЗБ 2001. године, развијена је коректна, партнерска и професионална комуникација са командом и јединицама КФОР-а. До сада је одржано 298 састанака Заједничке комисије, на којима су се тежишно разматрала питања у вези стања безбедности на КиМ и у Копненој зони безбедности. Редовно се дискутује о стању и евентуалним повредама административне линије и инцидентима у копненој и ваздушној зони безбедности.

Тежишни задаци Комисије за спровођење Војнотехничног споразума везани су за координацију активности, између снага безбедности Р.Србије и КФОР-а дуж административне линије, копнену и ваздушну зону безбедности, а поред осталог, подразумевају и праћење спровођења Војнотехничког и других споразума са КФОР-ом. Успешан процес непосредне реализације Споразума, базиран је пре свега на стручној, логистичкој и професионалној подршци Команде КоВ и квалитетном раду Тима Команде КоВ за сарадњу са КФОР-ом, као и официра за везу у бригадама, које се налазе у захвату административне линије са КиМ.

У 2007.години реализован је 221 састанак на свим нивоима сарадње и 308 једновремених патрола ВС/КФОР дуж административне линије са КиМ.

Комисија је учествовала у организацији више од 20 састанка на високом нивоу између начелника Генералштаба ВС и команданта КФОР-а.

У прва три месеца 2008. године реализовано је 56 састанака на свим нивоима и86 једновремених патрола.